Mortlach is opgericht in 1823 door James Findlater en was de eerste legale distillery in Dufftown. Zestig jaar later werd Glenfiddich opgericht door William Grant, die daarvoor jarenlang bij Mortlach werkte. In 1853 werd George Cowie mede eigenaar van Mortlach. Cowie was ingenieur, wetenschapper, onderzoeker en ondernemer. In 1896 nam zijn zoon Alexander het stokje van zijn vader over. Hij ontwierp het “2.81 distilled” proces, wat Mortlach tot op de dag van vandaag een bijzonder rijke, dikke en smaakvolle whisky maakt.
Mortlach is een belangrijk bestanddeel van de Johnnie Walker Black Label blend. Er waren zeer weinig officiele bottelingen van Mortlach, totdat eigenaar Diageo in 2014 vier officiele uitvoeringen lanceerde. Mortlach wordt daarbij als Luxury Single Malt gepresenteerd, met bijbehorende hoge prijsstelling.